0572-2022975
甲基化RNA免疫共沉淀(methylated RNA Immμnoprecipitation,meRIP)是通过甲基化抗体与甲基化修饰的碱基发生特异性结合,通过RNA免疫共沉淀技术,将发生甲基化的RNA区域,富集出来,然后通过高通量测序进行甲基化位点筛选或者RT-qPCR技术进行甲基化位点定量。
基安生物目前可以提供的服务:
甲基化修饰是RNA很重要的一种修饰方式,是表观遗传学研究的重要内容。根据目前研究6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)和5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C)是真核生物中最常见的两种RNA转录后修饰,其中又以M6A最为常见。
基安生物可以提供meRIP-seq,通过全基因组水平进行富集M6A甲基化位点,进行富集,然后通过高通量测序技术。通过生物信息学分析,发生甲基化修饰的位点参与的通路和生物学功能。此外,基安生物可以针对生物信息学预测或者高通量测序筛选出来的甲基化位点,设计特异性引物,进行RT-qPCR检测。
此外,基安生物可以提供代谢检测技术进行6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)和5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine,m5C)进行绝对定量。
根据目前研究参与甲基化研究的主要分为Writers,Erasers,Readers三部分功能,具体基因如下表:
功能类别 |
参与基因 |
可提供产品 |
Writers |
MELLTL3、METTL14、WTAP、KIAA1492、KIAA1429、RBM15/RBM15B、 ZC3H13、METTL16 |
siRNA,ASO,shRNA,过表达质粒,慢病毒,AAV,FISH等 |
Erasers |
FTO、ALKBH5 |
siRNA,ASO,shRNA,过表达质粒,慢病毒,AAV,FISH等 |
Readers |
YTHDF1-3、YTHDC1、YTHDC2、HNRNPA2B1 |
siRNA,ASO,shRNA,过表达质粒,慢病毒,AAV,FISH等 |