1、外显子测序
外显子组（exome）测序是利用序列捕获技术将全基因组外显子区域捕获并富集，通过构建外显子文库进行高通量测序。通过生物信息学分析能够直接发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变。相比于全基因组重测序，外显子组测序更加经济、高效，更适用于大样本量疾病及癌症样本分析。目前，外显子组测序技术已经应用到寻找与各种复杂疾病相关的致病基因和易感基因的研究中。
外显子测序流程图：

外显子测序流程

数据分析条目：

分析条目
2、全基因组测序
全基因组重测序是对已知参考基因组序列的物种进行不同个体间的基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。通过全基因组重测序，研究人员可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP)、拷贝数变异(Copy Nμmber Variation，CNV)、插入缺失(InDel，Insertion/Deletion)、结构变异(Strμctμre Variation，SV)等变异信息，应用范围涉及临床医药研究、群体遗传学研究、关联分析、进化分析等众多领域。

3、16S测序
16S 测序是利用高通量测序技术，通过检查环境或特定样本中微生物（主要是细菌）16S 特定可变区的丰度，以此鉴定环境标本细菌群落的分类及丰度的一门技术。16S 序列由 9 个高变区组成，中间穿插着保守区，是最常用的细菌分类标准。通过提取环境样品的 DNA，扩增其中 16S rDNA 基因，可以鉴定绝大多数细菌。基于高通量测序平台的 16S DNA 测序可以一次性完成多个样本的平行测序，提供环境样本物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化、群落比较等诸多信息。

16S测序流程图：


数据分析条目：

分析条目
4、宏基因组测序
宏基因组测序，是对特定环境样品中的微生物群落基因组进行高通量测序，以分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体的多样性与丰度，探求微生物与环境、微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。宏基因组测序研究避开了微生物分离培养的过程，扩展了微生物资源的利用空间，为微生物的研究提供了有效工具。
宏基因组测序流程图：

数据分析条目

5、RNA-seq转录组测序
polyA尾是mRNA由核内进入胞质所必须的一种结构，通过polyA尾富集试剂盒抓取的 3' 端polyA尾结构进行建库的测序方法，能够生物信息学分析所有的mRNA差异表达或结构变异，以及这些差异基因的参与的生物学通路或者生物学功能，分析参与发生表型改变的参与的基因。
基安生物拥有丰富的样本测序经验，哺乳动物组织和细胞，植物样本，微生物样本等样本测序。
mRNA研究思路：


RNA-seq测序流程图
 
转录组测序流程
数据分析

生物信息学分析流程


6、miRNA测序
Small RNA(micro RNAs、siRNAs和 pi RNA，siRNA等)是生命活动重要的调控因子，在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。主要包括miRNA，tsRNA，piRNA,snoRNA等，在不同的生物学功能中起到重要的调控功能。
高通量测序技术可以在单次测序中获得样品中所有小 RNA 的序列信息，从而分析不同疾病状态、不同人群来源、不同治疗方案下的小 RNA 表达水平，并精确比较特定组别的小 RNA 表达差异，从而为后续研究小RNA 的生物学意义提供指引。基安生物可以提供miRNA，tsRNA，piRNA，siRNA测序，以及生物信息学分析服务。

miRNA研究思路：


miRNA测序流程图
 

miRNA测序流程

miRNA分析流程
7、lncRNA测序
长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。 研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用，成为遗传学研究热点 。
基安生物采用去核糖体建库试剂盒，高通量测序，然后通过生物信息学分析，获得差异的lncRNA差异性表达以及参与的生物学功能。
研究思路：

测序流程
 
分析流程



8、circRNA测序
circRNA是非编码RNA的一大类，通过反向剪切的方式形成的共价闭合的环状结构RNA。circRNA通过线性RNA剪切而来，由一个或多个外显子构成。通过吸附miRNA或拥有编码潜能，进而参与生物学功能。
基安生物可以提供circRNA测序，通过生物信息学功能进行分析circRNA参与的生物学功能。此外，基安生物还可以提供特定circRNA编码潜能分析，circRNA成环验证实验，divergent与convergent引物设计实服务。
研究思路：


实验流程：


分析流程：



9、外泌体转录组测序
外泌体是指包含了复杂 RNA 和蛋白质的小膜泡 (30-150nm)，现今，其特指直径在40-100nm的盘状囊泡。包含核酸，蛋白质等物质，由机体的产生部位将信号分子或营养物质运送到集体的受体部位，进而发挥功能。
基安生物可以提供外泌体抽提实验，外泌体miRNA,lncRNA，circRNA,piRNA，外泌体蛋白组学测序；外泌体电镜，外泌体NTA，外泌体流式，外泌体RT-qPCR等实验服务。目前基安生物可以提供外泌体抽提试剂盒和超速离心两种方法进行外泌体分离。
研究思路：



10、蛋白组学
蛋白质组是基于质谱检测技术基础上探究生物体大规模蛋白质水平特征上研究，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。主要分为标记定量，非标记定量等。以4D-蛋白质组为例，是基于timsTOF Pro质谱仪，通过捕集离子淌度（TIMS）与同步累积连续碎裂（PASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学研究。该技术核心是在传统3D分离（保留时间、质荷比、离子强度）基础上，增加肽段的碰撞截面积（CCS），实现第4维度（离子淌度）的分离检测。 4D-DIA蛋白质组学是基于timsTOF Pro离子淌度平台的DIA技术，通过数据非依赖采集-同步累积连续碎裂（diaPASEF）扫描模式进行差异定量蛋白质组学分析。将DIA技术与基于timsTOF Pro上的diaPASEF技术相结合，具有高扫描速度和高灵敏度优势的同时，外加第四维离子淌度分离，使DIA数据在采集时不牺牲窗口循环速度的同时，降低谱图复杂度和提高离子利用率，实现了蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。
实验流程：
不同的样本分别进行蛋白样本提取，酶解，纯化，质谱测试等过程，如下图所示。
首先从不同样品中提取蛋白；其次经蛋白纯化，酶解，多肽纯化等步骤;然后样品送质谱测试；得到不同样本的质谱测试数据后，进行肽段匹配以及信号强度信息提取等等数据分析的步骤，最后得到不同样本中蛋白的表达相对量。

 

分析内容：

1. 样品原始质谱检测数据；2. 实验详细流程；3. 蛋白定性与定量结果列表；4. 层次聚类热图，5. 差异火山图，6. PCA主成分分析，7. 差异蛋白 GO 功能分析图；8. KEGG 通路图；9.蛋白互作网络图，10.  K-均值聚类图；11. 染色体定位图（若有染色体定位信息）12. IPA 相互作用网路图（限人源或鼠源）

11、代谢组学
代谢物是生物体表型的基础，能帮助更直观有效地了解生物学过程及其机理。基于对代谢物的定性定量分析，代谢组学可以用于代谢途径或代谢网络的解析，不同生物个体的宏观表型现象的代谢基础研究，不同疾病、药物等物理、化学或病原生物刺激后代谢产物的应答机制，以及食品、药物等安全评价。我们采用基于ΜPLC-MS/MS检测平台、自建数据库以及多元统计分析相结合的手段研究了样品间的代谢组差异。根据所关注的代谢物，可以分为非靶向/广泛靶向代谢，靶向代谢，脂质代谢，氨基酸代谢等不同细分检测。色谱与质谱联用实现了从利用色谱进行物质分离到利用质谱进行物质鉴定的整个流程。其中液相 色谱串联质谱（LC-MS/MS）能够准确定性定量。靶向代谢组学是指以特定代谢途径或者代谢物作为靶点进行示踪和分析的代谢组学。能够对代谢物进行精确的定量和定性研究有关的代谢反应和代谢产品。能够识别在该代谢过程中，代谢通路和代谢物质检的相互作用关系（需提供关注的代谢物）。
实验流程：
以非靶代谢为例，分析包括代谢组学实验及数据分析两大部分，其中数据分析主要包括差异代谢物筛选及代谢途径 解析。基于实验设计、样本的采集及处理、代谢物提取以及代谢物的检测分析获取的代谢组数据，可以 进行代谢物的鉴定与样本数据的质控分析，并筛选出一些有差异的代谢物，从而对样本的代谢物进行相 关的功能预测和分析。
 

结果分析：
 

1.样品原始质谱检测数据；2. 实验详细流程；3. 代谢物定性与定量结果列表；4. 数据结果评估（质控分析，PCA分析，OPLS-DA, 层次聚类热图），5. 差异代谢物筛选（差异火山图，差异代谢物雷达图，差异代谢物条形图，差异代谢物相关性分析等）6. 差异代谢物KEGG功能注释及富集分析（KEGG信号通路差异代谢物聚类分析，差异代谢物KEGG富集分析，KEGG代谢通路整体变化分析，差异代谢物的调控网络分析）7. HMDB功能注释及富集分析；8. MSEA富集分析；9.差异代谢物关联疾病，10.  K-均值聚类图；11.差异代谢物ROC曲线分析。